As Missionárias Combonianas iniciaram sua presença em Portugal em 1964, estabelecendo um marco importante na expansão da congregação na Península Ibérica. A escolha de Portugal foi estratégica, considerando a forte tradição católica do país e sua ligação histórica com África, especialmente com os países lusófonos.
Atualmente, mantêm presença ativa em três cidades principais: Lisboa, Porto e Viseu, onde desenvolvem diversos trabalhos pastorais e sociais, mantendo vivo o carisma de São Daniel Comboni através de uma presença ativa nas periferias sociais e existenciais do país.